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耐藥性結核即對多種藥物同時產生耐藥，就是說多種藥物同時對結核沒有治療作用。其中耐藥肺結核中耐多藥治療難度較大，就是該類型的肺結核對包括異煙肼和利福平在內的至少兩種藥物產生耐藥性。
專家分析導致耐藥性肺結核疾病治療難度大的主要包括4點：
（1）確診復雜：醫生想要判斷患者是否屬于耐多藥肺結核疾病，就需要對患者進行痰液培養，從而根據實際的檢查結果判斷患者是否存在多耐藥肺結核疾病。此外，當患者進行痰培養之后還需進行藥物過敏試驗，其所需要的時間共為 8 周左右，且需要使用特殊的藥物對患者進行培養以及過敏試驗。
（2）治療周期長：據悉耐多藥肺結核疾病的臨床治療周期則為18 ～ 24 個月，其是普通肺結核疾病患者所需治療時間的 3 ～6 倍左右。
（3）治療需要的藥物種類比較多、患者發生不良反應率比較高。像卷曲霉素、環絲氨酸、丙硫異煙胺等藥物患者服用后常會出現一些副作用，導致無法繼續治療。
（4）藥品費用昂貴：根據不完全統計結果顯示，耐多藥肺結核患者的治療藥物費用比普通肺結核治療費用高很多，而且也不再醫保報銷范圍內。
所以現階段關于結核耐藥怎么治療，臨床學者多年來不懈努力，在臨床中結合中醫學整體觀念及辯證施治療原則開展中西醫結合治療耐多藥肺結核研究，發現效果理想。多項成功案例也證明了中西醫結合可以顯著提升患者的臨床治療效果，同時降低患者在治療期間發生的不良反應，具有重要的臨床應用價值。
