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與普通結核病相比，耐藥結核病具有更嚴重的社會危害性，傳染性更強，治療時間更長、難度更大、費用更高。而且根據耐藥的類型不同，又分為多重耐藥和廣泛耐藥，其中多重耐藥結核病（MDR-TB）是指結核菌同時對兩種最有效的一線藥物利福平和異煙肼具有耐藥性，廣泛耐藥結核病（XDR-TB）是指在同時對利福平、異煙肼耐藥的基礎上，還對任意一種氟喹諾酮類藥物和三種二線藥物中的至少一種耐藥。
那么結核耐藥怎么治療？專家指出對于確診耐藥結核，要根據患者用藥史、耐藥情況以及耐藥結核菌株的流行情況等立即開展有針對性地治療。
目前化療仍是耐藥結核病的主要治療手段。WHO曾根據療效、耐藥類型和藥物分類將抗結核藥分為5組：異煙肼、乙胺丁醇等一線口服抗結核藥；卡那霉素、鏈霉素等注射用抗結核藥，氧氟沙星、莫西沙星等氟喹諾酮類藥，乙硫異煙胺、對氨基水楊酸等口服抑菌二線抗結核藥；氯法齊明、利奈唑胺、貝達喹啉、德拉馬尼等療效有待大樣本臨床試驗進一步證實的抗結核藥。
如果病情嚴重且符合手術適應證可手術干預，但至少3個月強化療基礎上采用手術來切除病灶和不斷排菌的空洞，對消滅耐藥病灶、促進痰菌陰轉。此外，中醫藥療法、營養支持療法等也常被用于耐藥結核的輔助治療。
正常情況下對于耐藥的肺結核患者，均要求釆用在醫務人員直接面視下服藥（DOT）的全程督導化療方式，患者應按照要求全程在醫務人員督導下服藥及治療。一般在開始治療的2個月期間，比較容易出現藥物不良反應，所以患者一定要留意和監測，如果出現一定要配合醫生調整治療方案，切勿自己擅自停藥處理。
